Se vivió un periodo de esplendor, en el que se levantaron los grandes edificios de la población, tal como aparece recogido en la fecha de construcción de las fachadas y se modificaron elementos arquitectónicos significativos: se amplió la iglesia, se elevó la torre….
La arquitectura civil de los siglos XVI a XVII recibió influencias italianas; 2 ó 3 plantas, galería de arcos en la planta bajocubierta, remate con grandes aleros de madera tallada y portadas de medio punto (p.e. Casa Guijarro o Casa Aliaga). En el S.XVIII pervivieron tipologías de los siglos anteriores con otras renovadas como la Casa Matutano-Daudén. (ver patrimonio cultural civil)
Se reconstruyó y amplió la Iglesia de la Purificación, modificando el espacio urbano de su entorno inmediato: se estrechó la calle de San Pablo rebasando con la ampliación el trazado de la muralla del primer recinto, se desvió la calle Ondevilla y se redujo la plaza de la Iglesia al invadirla con una nave lateral.
Síntoma de la expansión urbana por el crecimiento demográfico y económico, aparecieron nuevas construcciones extramuros en los márgenes opuestos de los riachuelos (barrios de la Costera y de las Eras) y posteriormente se demolieron tramos de muralla que obstaculizaban el crecimiento urbano.
La población estimada en la Iglesuela del Cid en este periodo;
- Año 1495 – 69 vecinos (Nota: cada vecino equivale a cuatro personas).
- Año 1718 – 75 vecinos
- Año 1797 – 256 vecinos